1995年、地球はザール星間帝国の急襲により全滅の危機に瀕していた。しかし、廃墟と化した日本で、助け合いながらたくましく生きる孤児たちがいた。楯剣人、柊弾児、早苗たちである。
剣人は実は、過去にザール帝国に滅ぼされたエリオス星皇帝の遺児だった。彼らはエリオスの忠臣であったアール博士と知り合い、アトラウスとガンパーという2つのメカを与えられ、ザール帝国と戦いながら第三のメカ、意思を持つライオンメカベラリオスを探すことになる。巨大ロボットダルタニアスに合体するためには、3つのメカが必要なのだ。ついに揃った三大メカは剣人の「クロスイン」の掛け声で合体、ザールから平和を取り戻すための心強い存在となる。
だが、この戦いの発端は、エリオス帝国に起こったある悲劇だったのだ…。
3頭身にディフォルメされたウルトラマンや怪獣たちが織り成すギャグアニメ。本作のウルトラマンたちは怪獣宇宙人たちと共存し、人間と同じように家庭を持ち、会社に勤めるなど、極度に擬人化されている点が特徴だ。
モタモタモーターズで勤めるウルトラマンは、妻や子供たちと幸せに暮らしていた。ある朝、ウルトラマンは長時間トイレに入って新聞を読んでいたため、会社に遅刻しそうになる。遅れを取り戻すべく、空を飛んで会社に向かおうとするが、警官に見つかり罰金を払うことに。そう、今やウルトラの星では空を飛ぶことが禁止されていたのだ。この一件を境に、彼の受難は続き……。