这个社会是否平等呢。真正的“实力”是什么?
东京都高度育成高等学校。那是宣扬彻底的实力至上主义,以升学率·就业率100%而引以为豪的升学学校。升入那里,被分配到1年D班的绫小路清隆,却发现学校与实力至上主义的招牌相反,学生每个月会得到相当于10万日元、与现金同等价值的分数,在授课和生活态度方面也贯彻放任主义。在梦幻般的高中生活当中,不断地挥金如土、过着自甘堕落日子的同班同学们。但,不久他就得知了学校系统的真面目,并被打入绝望的深渊……!
来自吊车尾聚集的D班的少年少女们所发现的,是世界的矛盾,还是正当的实力社会?
因双亲要在海外出差,所以一人留在日本的主人公以一年为期限住在了舅父的家里。之后转校到八十神高中的他得知一个深夜电视的传言在雨夜的十二时,只要看着关闭着的电视屏上自己的脸,就会浮现出另一个人的映像。主人公与同伴为了确认这一传言是否属实,不料被拉进了异空间,在那里被称为暗影的怪物袭击,与怪物接触时主角一行人的Persona能力觉醒。为了掘开深夜电视与连续杀人事件之间的关系,以及避免其他人被卷入该事件,他们组成了特别搜查队展开了战斗。